Yuuta Okkotsu è infestato dai fantasmi. Da quando la sua amica d'infanzia Rika è morta in un incidente stradale, il suo fantasma è rimasto con lui. Ma il suo spirito non appare come la dolce ragazza che Yuuta conosceva una volta. Invece, si manifesta come un'entità mostruosa e potente che lo protegge ferocemente. Incapace di controllare il comportamento violento di Rika, Yuuta è incapace di fermare lo spargimento di sangue che segue dalla sua brutale vendetta. Di conseguenza, quando viene catturato dagli stregoni "Jujutsu" - i guardiani segreti del mondo, addestrati a combattere forze come Rika - Yuuta desidera essere completamente isolato in modo che nessun altro possa farsi male. Eppure il suo catturatore, il maestro stregone Satoru Gojou, ha piani diversi per lui: si unirà alla Jujutsu High School e imparerà a controllare Rika per aiutare le persone. Ora al primo anno in questa scuola, Yuuta inizia a imparare le arti del Jujutsu e a combattere gli esseri maligni. Accanto ai suoi nuovi compagni di classe Maki Zenin, un esperto di armi Jujutsu; Toge Inumaki, un incantatore che usa le sue parole come armi; e Panda, un orso panda apparentemente ambulante e parlante, Yuuta inizia a trovare il suo posto nel mondo e, per una volta, a sentirsi a proprio agio con le sue capacità. Tuttavia, con il progredire della sua formazione, Yuuta viene a sapere che i pericoli del mondo Jujutsu vanno ben oltre quelli degli spiriti malvagi.